Intrón: Rozdiel medzi revíziami

z Wikipédie, slobodnej encyklopédie
Smazaný obsah Přidaný obsah
Bez shrnutí editace
d typografia
Riadok 1: Riadok 1:
[[File:Pre-mRNA to mRNA.svg|thumb|439x439px|Intróny a [[extrón]]y pri premene pre-mRNA na mRNA]]
[[File:Pre-mRNA to mRNA.svg|thumb|439x439px|Intróny a [[extrón]]y pri premene pre-mRNA na mRNA]]
'''Intrón '''je oblasť [[deoxyribonukleová kyselina|DNA]] a [[Primárny transkript|pre-mRNA]], ktorá sa neprekladá do [[Proteín|proteínu]], ale [[Posttranskripčná úprava|vystrihuje sa]] v priebehu tvorby [[mRNA]] mechanizmom zvaným [[splicing]] (zostrih). Spolu s [[exón]]mi tvorí základ [[gén]]u.
'''Intrón''' je oblasť [[deoxyribonukleová kyselina|DNA]] a [[Primárny transkript|pre-mRNA]], ktorá sa neprekladá do [[proteín]]u, ale [[Posttranskripčná úprava|vystrihuje sa]] v priebehu tvorby [[mRNA]] mechanizmom zvaným [[splicing]] (zostrih). Spolu s [[exón]]mi tvorí základ [[gén]]u.


== Výskyt ==
== Výskyt ==
Intróny môžeme bežne nájsť v [[genóm]]och organizmov z [[Doména (taxonómia)|nadríše]] [[Eukaryota]], kam sa zaraďujú napríklad všetky [[rastliny]], [[živočíchy]] a pod. <ref>
Intróny môžeme bežne nájsť v [[genóm]]och organizmov z [[Doména (taxonómia)|nadríše]] [[Eukaryota]], kam sa zaraďujú napríklad všetky [[rastliny]], [[živočíchy]] a pod.<ref>{{Citácia knihy
{{Citácia knihy
| priezvisko = Rosypal
| priezvisko = Rosypal
| meno = Stanislav
| meno = Stanislav
Riadok 16: Riadok 15:
| strany = 797
| strany = 797
| jazyk =
| jazyk =
}}</ref> Intróny však boli objavené i u [[Archea|archeí]] (najmä v génoch pre [[rRNA]] a [[tRNA]] <ref>
}}</ref> Intróny však boli objavené i u [[Archea|archeí]] (najmä v génoch pre [[rRNA]] a [[tRNA]],<ref>{{Citácia periodika
{{Citácia periodika
| priezvisko =
| priezvisko =
| meno =
| meno =
Riadok 34: Riadok 32:
| dátum prístupu = 2013-10-22
| dátum prístupu = 2013-10-22
| issn =
| issn =
}}</ref> ale aj v génoch kódujúcich proteíny),<ref> {{Citácia periodika
}}</ref>
, ale aj v génoch kódujúcich proteíny),<ref> {{Citácia periodika
| priezvisko =
| priezvisko =
| meno =
| meno =
Riadok 70: Riadok 67:
| dátum prístupu = 2013-10-22
| dátum prístupu = 2013-10-22
| issn =
| issn =
}}</ref> v niekoľkých prípadoch aj u [[Baktérie|baktérií]]. <ref>
}}</ref> v niekoľkých prípadoch aj u [[Baktérie|baktérií]].<ref>
{{Citácia periodika
{{Citácia periodika
| priezvisko =
| priezvisko =
Riadok 139: Riadok 136:


=== Parazitický pôvod ===
=== Parazitický pôvod ===
Intróny mohli byť pôvodne genómoví [[Parazitizmus|paraziti]] typu [[vírus]]ov a [[transpozón]]ov, ktoré [[Bunka|bunke]] neprinášajú úžitok, iba sa množia tým, že sa nakopírujú a vložia sa na ďalšie miesto v genóme hostiteľa. V [[populácia|populácii]] sa šíria vertikálne, t.j. z rodiča na potomka. Niektoré intróny sú schopné [[autosplicing]]u, vďaka čomu sa dokážu vystrihnúť z [[mRNA]] bez cudzej pomoci. Aby intróny nezabíjali bunky, musia sa vedieť v priebehu [[translácia (genetika)|translácie]] inaktivovať, na čo slúži práve splicing.
Intróny mohli byť pôvodne genómoví [[Parazitizmus|paraziti]] typu [[vírus]]ov a [[transpozón]]ov, ktoré [[Bunka|bunke]] neprinášajú úžitok, iba sa množia tým, že sa nakopírujú a vložia sa na ďalšie miesto v [[genóm]]e hostiteľa. V [[populácia|populácii]] sa šíria vertikálne, t.j. z rodiča na potomka. Niektoré intróny sú schopné [[autosplicing]]u, vďaka čomu sa dokážu vystrihnúť z [[mRNA]] bez cudzej pomoci. Aby intróny nezabíjali bunky, musia sa vedieť v priebehu [[translácia (genetika)|translácie]] inaktivovať, na čo slúži práve splicing.


=== Zvýšenie evolučného potenciálu ===
=== Zvýšenie evolučného potenciálu ===
Podľa tejto teórie umožňujú intróny účinnejší vznik nových génov prestavbou starých. Intróny sa v génoch nachádzajú v oblastiach, ktoré oddeľujú jednotlivé proteínové domény. Taktiež môžu uskutočňovať [[Crossing over|crossing-over]] tým, že znižujú pravdepodobnosť [[rekombinácia DNA|rekombinácie]] "vo vnútri" génovej sekvencie a tým i poškodenie génu postihnutím čítacieho rámca (pozri [[Mutácia (genetika)|mutácia]])
Podľa tejto teórie umožňujú intróny účinnejší vznik nových génov prestavbou starých. Intróny sa v génoch nachádzajú v oblastiach, ktoré oddeľujú jednotlivé proteínové domény. Taktiež môžu uskutočňovať [[Crossing over|crossing-over]] tým, že znižujú pravdepodobnosť [[rekombinácia DNA|rekombinácie]] "vo vnútri" génovej sekvencie a tým i poškodenie génu postihnutím čítacieho rámca (pozri [[Mutácia (genetika)|mutácia]]).


===Napojenie histónov ===
===Napojenie histónov ===

Verzia z 17:56, 7. november 2013

Intróny a extróny pri premene pre-mRNA na mRNA

Intrón je oblasť DNA a pre-mRNA, ktorá sa neprekladá do proteínu, ale vystrihuje sa v priebehu tvorby mRNA mechanizmom zvaným splicing (zostrih). Spolu s exónmi tvorí základ génu.

Výskyt

Intróny môžeme bežne nájsť v genómoch organizmov z nadríše Eukaryota, kam sa zaraďujú napríklad všetky rastliny, živočíchy a pod.[1] Intróny však boli objavené i u archeí (najmä v génoch pre rRNA a tRNA,[2] ale aj v génoch kódujúcich proteíny),[3][4] v niekoľkých prípadoch aj u baktérií.[5][6]

Vznik a evolučné dôsledky

Význam intrónov nie je úplne jasný. Existuje niekoľko teórií, ktoré vysvetľujú ich vznik a význam.

Parazitický pôvod

Intróny mohli byť pôvodne genómoví paraziti typu vírusov a transpozónov, ktoré bunke neprinášajú úžitok, iba sa množia tým, že sa nakopírujú a vložia sa na ďalšie miesto v genóme hostiteľa. V populácii sa šíria vertikálne, t.j. z rodiča na potomka. Niektoré intróny sú schopné autosplicingu, vďaka čomu sa dokážu vystrihnúť z mRNA bez cudzej pomoci. Aby intróny nezabíjali bunky, musia sa vedieť v priebehu translácie inaktivovať, na čo slúži práve splicing.

Zvýšenie evolučného potenciálu

Podľa tejto teórie umožňujú intróny účinnejší vznik nových génov prestavbou starých. Intróny sa v génoch nachádzajú v oblastiach, ktoré oddeľujú jednotlivé proteínové domény. Taktiež môžu uskutočňovať crossing-over tým, že znižujú pravdepodobnosť rekombinácie "vo vnútri" génovej sekvencie a tým i poškodenie génu postihnutím čítacieho rámca (pozri mutácia).

Napojenie histónov

Táto hypotéza predpokladá schopnosť posúvať históny po DNA tak, že regulujú vystavenie regulačných miest génu podľa toho, či je regulačná sekvencia namotaná na histón, alebo sa nachádza v cytoplazme.

Referencie

  1. ROSYPAL, Stanislav. Nový přehled biologie. Praha : Scientia, 2003. ISBN 80-7183-268-5. S. 797.
  2. Lykke-Andersen J., Aagaard C., Semionenkov M., Garrett R. A.. Archaeal introns: splicing, intercellular mobility and evolution. Trends Biochem. Sci., roč. 22, čís. 9.
  3. Watanabe Y., Yokobori S., Inaba T., et al. Introns in protein-coding genes in Archaea. FEBS Lett., roč. 510, čís. 1-2, s. 27-30.
  4. Yoshinari S., Itoh T., Hallam S. J., et al. Archaeal pre-mRNA splicing: a connection to hetero-oligomeric splicing endonuclease. Biochem. Biophys. Res. Commun., August 2006, roč. 346, čís. 3, s. 1024–32.
  5. Belfort M, Reaban ME, Coetzee T, Dalgaard JZ. Prokaryotic introns and inteins: a panoply of form and function. J. Bacteriol., 1995, roč. 177, čís. 14, s. 3897–903.
  6. MOHR, G.; GHANEM, E.; LAMBOWITZ, A. M.. Mechanisms Used for Genomic Proliferation by Thermophilic Group II Introns. PLoS Biology, 8. jún 2010, zväzok 8,  6. Dostupné online [PDF]. (anglický)