Vodnopólová extraliga mužov v sezóne 1996/97 bol v poradí 5. ročník extraligy vodnopólistov, najvyššej vodnopólovej súťaže mužov na Slovensku, ktorú organizoval Slovenský zväz vodného póla (SZVP). Počet účastníkov sa oproti minulej sezóne znížil o 3 družstvá na číslo 6. V tomto ročníku sa prvýkrát hralo systémom jeseň-jar.[1] Svoj druhý titul získalo družstvo Slávia UK Bratislava, ktoré vo finálovom dueli zvíťazilo nad obhajcom z KVP NCHZ Nováky.
Systém súťaže sa opäť menil, už štvrtú sezónu za sebou. Súťaž sa skladala z troch častí. V základnej časti (ZČ) odohrali družstvá zápasy systémom každý s každým. 4 najlepšie potom postúpili do nadstavbovej časti o majstra. Zvyšné 2 družstvá odohrali skupinu o zotrvanie, resp. o postup do extraligy z 2 účastníkmi 1. ligy. Nadstavbová časť sa odohrala formou 4 turnajov; každé družstvo hostilo 1 turnaj. Body zo ZČ sa započítavali iba v skupine o majstra. Po odohraní nadstavbovej časti v skupine o majstra nasledovalo play-off. Semifinále, finále a duel o bronz sa hrali na dve hrané stretnutia.