Základné reprodukčné číslo: Rozdiel medzi revíziami
potrebujem len tabulku pomylil som sa a clanok ma byt ako Základné reprodukčné číslo |
Bez shrnutí editace Značky: sekcia Referencie vizuálny editor |
||
Riadok 1: | Riadok 1: | ||
[[Súbor:Daily_R_ratio_Czech_republic_COVID-19.png|náhľad| Efektívne index nákazlivosti v SR počas [[Pandémia ochorenia COVID-19|pandémie covidu-19]] v marci 2020]]{{pracuje sa}}'''Základné reprodukčné číslo''' (tiež '''index nákazlivosti,''' skratka '''R |
[[Súbor:Daily_R_ratio_Czech_republic_COVID-19.png|náhľad| Efektívne index nákazlivosti v SR počas [[Pandémia ochorenia COVID-19|pandémie covidu-19]] v marci 2020]]{{pracuje sa}}'''Základné reprodukčné číslo''' (tiež '''index nákazlivosti,''' skratka '''R<sub>0</sub>''' <nowiki>''basic reproduction number''</nowiki> je v [[Epidemiológia|epidemiológii]] pre konkrétne [[Infekčná choroba|infekčné ochorenie]] číslo vyjadrujúce koľko ďalších ľudí nakazí v priemere jeden infikovaný touto chorobou v populácii, kde všetci jedinci sú k tejto chorobe náchylní (tj. nemajú vytvorenú [[Imunita (biológia)|imunitu]], či už prirodzenú alebo vďaka [[Očkovanie|očkovaniu]]).<ref name="Fraser">{{Citácia periodika|doi=10.1126/science.1176062}}Free text</ref> Základné reprodukčné číslo udáva počiatočnú hodnotu nákazlivosti v danej populácii podľa použitého modelu, a to pred prijatím ochranných opatrení. Je to základný odhad odhad infekčnosti ochorenia.<ref name="nzip1111">[[NZIP]]: [https://www.nzip.cz/rejstrikovy-pojem/1111 Reprodukční číslo]</ref> Podľa [[Svetová zdravotnícka organizácia|Svetovej zdravotníckej organizácie]] (WHO) má ochorenie [[COVID-19]] za bežných podmienok reprodukčné číslo okolo 2,3 , čo znamená, že je to oveľa viac infekčnejší ako ako bežná chrípka, ktorá má reprodukčné číslo 1,3.<ref>{{Citácia elektronického dokumentu|titul=Hľadá sa číslo R0. Ako rýchlo sa šíri vírus na Slovensku, keď dodržiavame opatrenia, a prečo sú o to spory|url=https://dennikn.sk/1841251/hlada-sa-cislo-r0-ako-rychlo-sa-siri-virus-na-slovensku-ked-dodrziavame-opatrenia-a-preco-su-o-to-spory/|vydavateľ=Denník N|dátum vydania=2020-04-07|dátum prístupu=2021-09-14|jazyk=sk-SK|meno=Tomáš|priezvisko=Vasilko}}</ref> |
||
Index nákazlivosti R |
Index nákazlivosti R<sub>0</sub> by sa nemal zamieňať s '''efektívnym reprodukčnom číslom''' (skratka '''R <sub>t),</sub>''' ktoré označuje nákazlivosť infekcie v populácii v danom čase ''t'' (s indexom ''t)'' a používa sa na sledovanie vývoja epidemiologickej situácie v populácii. Pre R<sub>t</sub> väčšie ako 1 počet novo nakazených stúpa. Čím je R<sub>t</sub> vyššie, tým sa nákaza šíri rýchlejšie. Pre R<sub>t</sub> menšie ako 1 počet novo nakazených naopak klesá, môžeme očakávať vyhasnutia [[Epidémia|epidémie]]. |
||
== Charakteristika == |
== Charakteristika == |
||
Niektoré definície indexu nákazlivosti, napríklad definícia austrálskeho ministerstva zdravotníctva, dodávajú absenciu ''"akéhokoľvek úmyselného zásahu do prenosu choroby".'' |
Niektoré definície indexu nákazlivosti, napríklad definícia austrálskeho ministerstva zdravotníctva, dodávajú absenciu ''"akéhokoľvek úmyselného zásahu do prenosu choroby".''<ref>{{Cite web|url=https://www1.health.gov.au/internet/publications/publishing.nsf/Content/mathematical-models~mathematical-models-models.htm~mathematical-models-2.2.htm|title=Department of Health {{!}} 2.2 The reproduction number}}</ref> Z definície vyplýva, že index nákazlivosti nemožno modifikovať očkovacími kampaňami. R<sub>0</sub> je bezrozmerné číslo. Nejedná sa teda o mieru súvisiacu s jednotkou času.<ref>{{Cite web|url=https://web.stanford.edu/~jhj1/teachingdocs/Jones-on-R0.pdf|title=Notes On R0}}</ref> <ref>{{Cite web|url=https://www.forbes.com/sites/startswithabang/2020/03/17/why-exponential-growth-is-so-scary-for-the-covid-19-coronavirus/|title=Why 'Exponential Growth' Is So Scary For The COVID-19 Coronavirus}}</ref> |
||
{| class="wikitable sortable" align="right" style="margin-left: 1em; text-align:center" |
{| class="wikitable sortable" align="right" style="margin-left: 1em; text-align:center" |
||
|+Index nákazlivosti niektorých známych infekčných chorôb <ref name="Smallpox">Není-li uvedeno jinak, hodnota indexu nakažlivosti je převzata z [https://stacks.cdc.gov/view/cdc/27929 History and Epidemiology of Global Smallpox Eradication]( {{Wayback|url=https://stacks.cdc.gov/view/cdc/27929|date=20160510000000}}), a module of the training course "Smallpox: Disease, Prevention, and Intervention". The CDC and the [[Svetová zdravotnícka organizácia|World Health Organization]], 2001. Slide 17. This gives sources as "Modified from ''[[Epidemiologic Reviews|Epid Rev]]'' 1993;15: 265-302, ''[[American Journal of Preventive Medicine|Am J Prev Med]]'' 2001; 20 (4S): 88-153, ''[[Morbidity and Mortality Weekly Report|MMWR]]'' 2000; 49 (SS-9); 27-38"</ref> |
|+Index nákazlivosti niektorých známych infekčných chorôb <ref name="Smallpox">Není-li uvedeno jinak, hodnota indexu nakažlivosti je převzata z [https://stacks.cdc.gov/view/cdc/27929 History and Epidemiology of Global Smallpox Eradication]( {{Wayback|url=https://stacks.cdc.gov/view/cdc/27929|date=20160510000000}}), a module of the training course "Smallpox: Disease, Prevention, and Intervention". The CDC and the [[Svetová zdravotnícka organizácia|World Health Organization]], 2001. Slide 17. This gives sources as "Modified from ''[[Epidemiologic Reviews|Epid Rev]]'' 1993;15: 265-302, ''[[American Journal of Preventive Medicine|Am J Prev Med]]'' 2001; 20 (4S): 88-153, ''[[Morbidity and Mortality Weekly Report|MMWR]]'' 2000; 49 (SS-9); 27-38"</ref> |
||
Riadok 75: | Riadok 75: | ||
| 0,3-0,8 <ref>{{Citácia periodika|doi=10.2807/1560-7917.ES2015.20.25.21167}}</ref> |
| 0,3-0,8 <ref>{{Citácia periodika|doi=10.2807/1560-7917.ES2015.20.25.21167}}</ref> |
||
|} |
|} |
||
== Odtiaľto nedorobené - asi vymazať tabuľku == |
|||
Index nákazlivosti nie je pre [[patogén]] biologická [[konštanta]], pretože je ovplyvňovaný ďalšími faktormi, ako vhodnosť prostredie pre šírenie patogénu a správanie infikované populácie. Hodnoty R <sub>0</sub> sú obvykle odhadujú z matematických modelov a bývajú preto závislé od použitého modelu a hodnotách ďalších použitých parametrov. Hodnoty uvádzané v literatúre teda majú zmysel len v danom kontexte. Neodporúča sa preto používať zastarané hodnoty alebo porovnávať hodnoty založenej na rôznych modeloch. <ref>{{Citácia periodika|doi=10.3201/eid2501.171901|issn=1080-6040}}</ref> Index R <sub>0</sub> sám o sebe nedáva odhad, ako rýchlo sa infekcia šíri v populácii. Reprodukčné číslo má zmysel iba pre populačné skupiny, v ktorej sa epidémia reálne šíri. V situácii, keď existujú len lokálne ohniská a vo zvyšku populácie či štátu sa ochorenie prakticky nevyskytuje, neposkytuje celkové R v podstate žiadnu validný informáciu. <ref name="nzip1111">[[NZIP]]: [https://www.nzip.cz/rejstrikovy-pojem/1111 Reprodukční číslo]</ref> |
Index nákazlivosti nie je pre [[patogén]] biologická [[konštanta]], pretože je ovplyvňovaný ďalšími faktormi, ako vhodnosť prostredie pre šírenie patogénu a správanie infikované populácie. Hodnoty R <sub>0</sub> sú obvykle odhadujú z matematických modelov a bývajú preto závislé od použitého modelu a hodnotách ďalších použitých parametrov. Hodnoty uvádzané v literatúre teda majú zmysel len v danom kontexte. Neodporúča sa preto používať zastarané hodnoty alebo porovnávať hodnoty založenej na rôznych modeloch. <ref>{{Citácia periodika|doi=10.3201/eid2501.171901|issn=1080-6040}}</ref> Index R <sub>0</sub> sám o sebe nedáva odhad, ako rýchlo sa infekcia šíri v populácii. Reprodukčné číslo má zmysel iba pre populačné skupiny, v ktorej sa epidémia reálne šíri. V situácii, keď existujú len lokálne ohniská a vo zvyšku populácie či štátu sa ochorenie prakticky nevyskytuje, neposkytuje celkové R v podstate žiadnu validný informáciu. <ref name="nzip1111">[[NZIP]]: [https://www.nzip.cz/rejstrikovy-pojem/1111 Reprodukční číslo]</ref> |
||
Verzia z 12:59, 14. september 2021
Na tomto článku sa práve pracuje. Prosím, nezasahujte. Kým je tu zobrazená táto správa, prosím, neupravujte túto stránku. Vyhnete sa tak prípadným konfliktom pri ukladaní. Redaktor, ktorý sem pridal tento oznam, je uvedený v histórii, ak by ste ho chceli kontaktovať. |
Základné reprodukčné číslo (tiež index nákazlivosti, skratka R0 ''basic reproduction number'' je v epidemiológii pre konkrétne infekčné ochorenie číslo vyjadrujúce koľko ďalších ľudí nakazí v priemere jeden infikovaný touto chorobou v populácii, kde všetci jedinci sú k tejto chorobe náchylní (tj. nemajú vytvorenú imunitu, či už prirodzenú alebo vďaka očkovaniu).[1] Základné reprodukčné číslo udáva počiatočnú hodnotu nákazlivosti v danej populácii podľa použitého modelu, a to pred prijatím ochranných opatrení. Je to základný odhad odhad infekčnosti ochorenia.[2] Podľa Svetovej zdravotníckej organizácie (WHO) má ochorenie COVID-19 za bežných podmienok reprodukčné číslo okolo 2,3 , čo znamená, že je to oveľa viac infekčnejší ako ako bežná chrípka, ktorá má reprodukčné číslo 1,3.[3]
Index nákazlivosti R0 by sa nemal zamieňať s efektívnym reprodukčnom číslom (skratka R t), ktoré označuje nákazlivosť infekcie v populácii v danom čase t (s indexom t) a používa sa na sledovanie vývoja epidemiologickej situácie v populácii. Pre Rt väčšie ako 1 počet novo nakazených stúpa. Čím je Rt vyššie, tým sa nákaza šíri rýchlejšie. Pre Rt menšie ako 1 počet novo nakazených naopak klesá, môžeme očakávať vyhasnutia epidémie.
Charakteristika
Niektoré definície indexu nákazlivosti, napríklad definícia austrálskeho ministerstva zdravotníctva, dodávajú absenciu "akéhokoľvek úmyselného zásahu do prenosu choroby".[4] Z definície vyplýva, že index nákazlivosti nemožno modifikovať očkovacími kampaňami. R0 je bezrozmerné číslo. Nejedná sa teda o mieru súvisiacu s jednotkou času.[5] [6]
choroba | spôsob prenosu | R 0 |
---|---|---|
osýpky | vzduchom | 12-18 [8] |
ovčie kiahne | vzduchom | 10-12 |
mumps | kvapôčkami | 10-12 |
detská obrna | fekáliami, slinami | 5-7 |
rubeola | kvapôčkami | 5-7 |
čierny kašeľ | kvapôčkami | 5,5 [9] |
pravé kiahne | kvapôčkami | 3,5-6 [10] |
HIV / AIDS | telesnými tekutinami | 2-5 |
SARS | kvapôčkami | 2-5 |
záškrt | slinami | 1,7-4,3 [11] |
covid-19 | kvapôčkami | 1,4-3,9 [12] [13] [14] [15] [16] |
chrípka </br> ( Španielska chrípka, 1918-1920) |
kvapôčkami | 1,4-2,8 [17] |
ebola </br> ( Epidémie v západnej Afrike, 2013-2016) |
telesnými tekutinami | 1,5-2,5 [18] |
chrípka </br> ( Mexická prasacia chrípka, 2009-2010) |
kvapôčkami | 1,4-1,6 [19] |
chrípka </br> (sezónne epidémie) |
kvapôčkami | 0,9-2,1 [19] |
MERS | kvapôčkami | 0,3-0,8 [20] |
Odtiaľto nedorobené - asi vymazať tabuľku
Index nákazlivosti nie je pre patogén biologická konštanta, pretože je ovplyvňovaný ďalšími faktormi, ako vhodnosť prostredie pre šírenie patogénu a správanie infikované populácie. Hodnoty R 0 sú obvykle odhadujú z matematických modelov a bývajú preto závislé od použitého modelu a hodnotách ďalších použitých parametrov. Hodnoty uvádzané v literatúre teda majú zmysel len v danom kontexte. Neodporúča sa preto používať zastarané hodnoty alebo porovnávať hodnoty založenej na rôznych modeloch. [21] Index R 0 sám o sebe nedáva odhad, ako rýchlo sa infekcia šíri v populácii. Reprodukčné číslo má zmysel iba pre populačné skupiny, v ktorej sa epidémia reálne šíri. V situácii, keď existujú len lokálne ohniská a vo zvyšku populácie či štátu sa ochorenie prakticky nevyskytuje, neposkytuje celkové R v podstate žiadnu validný informáciu. [2]
Index nákazlivosti R 0 sa používa predovšetkým pri určovaní, či sa novo objevivší infekčné ochorenie môže rozšíriť v populácii, a aký podiel populácie by mal byť imunizovaný očkovaním k eradikáciu ochorení. V bežne používaných modeloch platí, že keď je R 0> 1, infekcia má potenciál začať sa šíriť v populácii. Všeobecne platí, že čím vyššia je hodnota R 0, tým ťažšie je udržať potenciálny epidémiu pod kontrolou. U jednoduchých modelov platí, že podiel populácie, ktorá musí byť účinne imunizované (tj. Že nebude už ďalej náchylná k infekcii), aby sa zabránilo trvalému šíreniu infekcie, musí byť väčšia ako 1 - 1 / R 0. [22] Naopak, podiel populácie, ktorá zostáva náchylná k infekcii v endemickej rovnováhe, je 1 / R 0.
Index nákazlivosti je ovplyvňovaný rôznymi faktormi, ako doba nákazlivosti chorých, infekčnosť organizmu (množstvo organizmom ďalej šírených patogénov) a počet náchylných ľudí v populácii, s ktorými sú nakazení v kontakte.
metódy odhadu
Počas epidémie je zvyčajne známy počet pozitívne diagnostikovaných prípadov za čas . V počiatkoch epidémie je rast prípadov exponenciálny, pričom rýchlosť rastu je logaritmická:
Keďže ide o exponenciálny rast, môže byť interpretované ako kumulatívny počet pozitívne diagnostikovaných prípadov (vrátane osôb, ktoré sa úspešne vyliečili) alebo ako aktuálny počet diagnostikovaných pacientov; logaritmické miera rastu je rovnaká pre obidve definície. pre výpočet je následne potrebné odhadnúť dobu medzi vystavením sa infekcii a diagnózou a dobu medzi vystavením sa infekcii a okamihom, kedy nakazená osoba začne infekciu sama šíriť ďalej.
V tomto modeli má infekcie nasledujúce fázy:
- Expozícia: jedinec je nakazený, nevykazuje symptómy, a nie je zatiaľ nákazlivý (neprenáša infekcii). Doba expozície je .
- Latencia: jedinec je nakazený, nevykazuje symptómy, ale je nákazlivý (prenáša infekciu). Doba latencie je . Počas tejto doby nakazí priemerne ďalších osôb.
- Izolácia po diagnostikovaní: jedinec je stále nákazlivý, ale sú prijaté opatrenia (napríklad umiestnením nakazené osoby do izolácie), aby sa infekcia ďalej nešírila.
V modeli Seir možno vyjadriť nasledovným vzorcom: [23]
Táto metóda odhadu bola aplikovaná na covid-19 a SARS . [24] Ide o riešenie diferenciálnej rovnice:
je počet jedincov v období expozície a počet jedincov v období latencie. je logaritmické miera rastu spomínaná vyššie.
odkazy
Referencie
Tento článok je čiastočný alebo úplný preklad článku Basic reproduction number na anglickej Wikipédii.
- ↑ Parameter "periodikum" je povinný!. DOI: 10.1126/science.1176062. Free text
- ↑ a b NZIP: Reprodukční číslo
- ↑ VASILKO, Tomáš. Hľadá sa číslo R0. Ako rýchlo sa šíri vírus na Slovensku, keď dodržiavame opatrenia, a prečo sú o to spory [online]. Denník N, 2020-04-07, [cit. 2021-09-14]. Dostupné online.
- ↑ Department of Health | 2.2 The reproduction number [online]. . Dostupné online.
- ↑ Notes On R0 [online]. . Dostupné online.
- ↑ Why 'Exponential Growth' Is So Scary For The COVID-19 Coronavirus [online]. . Dostupné online.
- ↑ Není-li uvedeno jinak, hodnota indexu nakažlivosti je převzata z History and Epidemiology of Global Smallpox Eradication( Archív 10. mája 2016 na Wayback Machine), a module of the training course "Smallpox: Disease, Prevention, and Intervention". The CDC and the World Health Organization, 2001. Slide 17. This gives sources as "Modified from Epid Rev 1993;15: 265-302, Am J Prev Med 2001; 20 (4S): 88-153, MMWR 2000; 49 (SS-9); 27-38"
- ↑ Parameter "periodikum" je povinný!. Dostupné online. ISSN 1473-3099. DOI: 10.1016/S1473-3099(17)30307-9.
- ↑ Parameter "periodikum" je povinný!. DOI: 10.1371/journal.pmed.1000291.
- ↑ Parameter "periodikum" je povinný!. Dostupné online. ISSN 1476-4687. DOI: 10.1038/414748a.
- ↑ Parameter "periodikum" je povinný!. Dostupné online. DOI: 10.1093/cid/ciz808.
- ↑ Parameter "periodikum" je povinný!. DOI: 10.1056/NEJMoa2001316.
- ↑ Parameter "periodikum" je povinný!. DOI: 10.2807/1560-7917.ES.2020.25.4.2000058.
- ↑ Parameter "periodikum" je povinný!. DOI: 10.1101/2020.01.25.919787.
- ↑ Parameter "periodikum" je povinný!. DOI: 10.1101/2020.01.23.20018549.
- ↑ Parameter "periodikum" je povinný!. Dostupné online. ISSN 1546-170X. DOI: 10.1038/s41591-020-0822-7.
- ↑ Parameter "periodikum" je povinný!. DOI: 10.1038/nature04795.
- ↑ Parameter "periodikum" je povinný!. DOI: 10.1371/currents.outbreaks.91afb5e0f279e7f29e7056095255b288.
- ↑ a b Parameter "periodikum" je povinný!. DOI: 10.1186/1741-7015-7-30.
- ↑ Parameter "periodikum" je povinný!. DOI: 10.2807/1560-7917.ES2015.20.25.21167.
- ↑ Parameter "periodikum" je povinný!. ISSN 1080-6040. DOI: 10.3201/eid2501.171901.
- ↑ Parameter "periodikum" je povinný!. Dostupné online. ISSN 1058-4838. DOI: 10.1093/cid/cir007.
- ↑ Parameter "periodikum" je povinný!. ISSN 0036-8075. DOI: 10.1126/science.1086616.
- ↑ Parameter "periodikum" je povinný!. Dostupné online. DOI: 10.1101/2020.01.27.20018952v1.