Preskočiť na obsah

Alfa-proteobaktérie

z Wikipédie, slobodnej encyklopédie
 Práve prebieha diskusia o tom, ktorú z dvoch verzií má mať táto stránka
Jednu z verzií vidno nižšie, druhú je vidno na tomto mieste (porovnajte rozdiel medzi nimi), pričom prípadné ďalšie verzie sú dostupné v histórii stránky.
Prosím, neupravujte stránku do druhej navrhovanej verzie, kým sa tak nerozhodne v diskusii.
Alfa-proteobaktérie
Vedecká klasifikácia
 
Vedecký názov
Alphaproteobacteria
Garrity, Bell & Lilburn, 2006
Vedecká klasifikácia prevažne podľa tohto článku

Alfa-proteobaktérie[1] alebo alfaproteobaktérie[2] (lat. Alphaproteobacteria) sú trieda baktérií z kmeňa Pseudomonadota, ktorý sa staršie nazýval proteobaktérie (Proteobacteria).

Charakteristika

[upraviť | upraviť zdroj]

Alfa-proteobaktérie sú gramnegatívne baktérie. Zahŕňajú fototrofné aj heterotrofné druhy. Veľa alfa-proteobaktérií žije v symbióze, napríklad rod Rhizobium, naopak veľa druhov sú patogény rastlín (rod Agrobacterium) a človeka (rod Rickettsia). Podľa endosymbiotickej teórie pochádza mitochondria eukaryotických organizmov práve z endosymbiotických baktérií príbuzných dnešným alfa-proteobaktériám.[3]

Systematika

[upraviť | upraviť zdroj]

Prvý opis

[upraviť | upraviť zdroj]

Taxón dnes nazývaný alfa-proteobaktérie prvýkrát taxonomicky pomenoval a publikoval Cavalier-Smith v roku 1992 (resp. podľa niektorých názorov formálne platne až v roku 2002). Nazýval ho Alphabacteria.[4][5]

Názov taxónu v jeho dnešnej podobe, t. j, (trieda) Alphaproteobacteria, bol síce vytvorený a prvýkrát publikovaný už v roku 2001[6], ale formálne bol platne publikovaný až v roku 2005/2006[7].

Synonymá a taxonomická úroveň

[upraviť | upraviť zdroj]

Neformálne sa názov triedy Alphaproteobacteria niekedy uvádza v podobe ɑ-proteobacteria.[8][4] Alternatívny názov triedy Alphaproteobacteria je (trieda) Caulobacteria[9]. Staršie názvy taxónu Alphaproteobacteria sú: (trieda alebo infrakmeň) Alphabacteria[10][5], (angl.) Alpha Group [of Proteobacteria] (doslova: alfa-skupina [proteobaktérií])[11], (angl.) alpha subgroup [of Proteobacteria] (doslova: alfa-podskupina [proteobaktérií])[4], (angl.) alpha subdivision [of purple bacteria/of Proteobacteria] (doslova: alfa-pododdelenie [purpurových baktérií/proteobaktérií])[4]. Posledné tri uvedené anglické názvy sú len neformálne názvy.

Taxón alfa-proteobaktérie má síce najčastejšie úroveň triedy, ale niektorí autori mu priraďujú úroveň (triedy a zároveň) kmeňa, ktorý sa volá buď Alphaproteobacteria[12] alebo Alphaproteobacteriota alebo Alphaproteobacteraeota[13].

Rady

[upraviť | upraviť zdroj]

Bergey's Manual 2001

[upraviť | upraviť zdroj]

Prvý opis triedy pod jej dnešným názvom Alphaproteobacteria bol publikovaný v roku 2001 v 2. vydaní Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Trieda "Alphaproteobacteria" v ňom pozostáva z nasledujúcich radov (zoradené podľa abecedy):[6]

LPSN

[upraviť | upraviť zdroj]

Podľa vydaní LPSN z obdobia od roku 2007 do roku 2018 pozostávala trieda Alphaproteobacteria z nasledujúcich radov (zoradené podľa abecedy):[14][15][16][17][18]

Rady tu vyššie uvedené bez komentára boli v systéme uvedené od roku 2007, zatiaľ čo rady vyššie uvedené s komentárom (o roku ich vytvorenia) boli do systému postupne pridané neskôr.

Podľa LPSN z leta 2026 pozostáva trieda Alphaproteobacteria z týchto radov (zoradené podľa abecedy):[7]

GTDB 2026

[upraviť | upraviť zdroj]

Podľa GTDB z roku 2026 (release 232) trieda Alphaproteobacteria pozostáva z týchto radov (zoradené podľa abecedy):[19]
16-39-46, 43-37, Acetobacterales, ATCC43930, Azospirillales, BNTO01, BOG-932, Bin65, Bin95, Bin98, CAAGCB01, CAAHEQ01, CACIAM-22H2, CACZRW01, CADEGL01, Caedimonadales, CAISDR01, CAISOG01, CAIYWZ01, CAJXXZ01, CAKMZR01, CALKHQ01, CALMVH01, CASFRQ01, Caulobacterales, CAVTAV01, CAWBKL01, CAWJRW01, CAYFNG01, CAYGJW01, CAYJES01, CAYNIS01, CAYWTE01, CAZCBM01, CAZEQG01, CAZMTC01, CAZPBH01, CAZRBL01, CAZZKF01, CBCXTS01, CBDBCS01, CBDDJK01, CBDUYM01, CBDUZE01, CBDVDY01, CGMCC-115125, DAOWDM01, DATDPM01, Dongiales, DSM-16000, Elsterales, Ferrovibrionales, Futianiales, G022571365, G02398745, G027485855, G963923945, G965218375, G965222575, GCA-002720895, GCA-016699305, GCA-2721365, GCS-2731375, GCS-2746255, Geminicoccales, GM7ARS4, HIMB59, Holosporales, JAAEOK01, JAAXGF01, JABAAW01, JABSOH01, JACAEB01, JACQOE01, JACZXZ01, JAEUKQ01, JAEULC01, JAEULF01, JAGOMX01, JAGPBS01, JAIXQD01, JAJFFI01, JAJFIK01, JAJTHO01, JAJUGE01, JAKJEU01, JALCBB01, JALRGP01, JALYJY01, JANQFL01, JANQMY01, JANQSM01, JANSWW01, JAOXRX01, JAPKNN01, JAPOUT01, JAPULJ01, JAPYRI01, JAQWUY01, JAREAF01, JASGCL01, JAUHZC01, JAUHZY01, JAUXUR01, JAVJRE01, JAVJVX01, JAWKYA01, JAXMDU01, JBBDQX01, JBCCHK01, JBCCNR01, JBDZUN01, JBFXJJ01, JBHICW01, JBHICX01, JBILKX01, JBJEAR01, JBMOFM01, Kiloniellales, M2410, MC1, MED-G09, Methylaequorales, Micavibrionales, Micropepsales, Minwuiales, MPNO01, Oceanibaculales, Paracaedibacterales, Parvibaculales, Pelagibacterales, Puniceispirillales, QKFK01, Radicibacterales, Reyranellales, RF32, Rhizobiales, Rhodobacterales, Rhodospirillales, Rickettsiales, RS24, Rs-D84, RUG11792, SHNJ01, SHVP01, SHVV01, SHVW01, SHVZ01, SHWA01, SMXP01, SMXQ01, SMXS01, Sneathiellales, SP197, Sphingomonadales, SPJN01, Thalassobaculales, Tistrellales, TMED109, TMED2, UBA11073, UBA11136, UBA11222, UBA 1247, UBA1280, UBA2136, UBA2400, UBA2562, UBA2966, UBA3830, UBA6184, UBA6615, UBA7879, UBA7887, UBA7985, UBA828, UBA8317, UBA8366, UBA8558, UBA9219, UBA9655, VGDZ01, VGEJ01, WRAU01, WRDZ01, Zavarziniales.

Referencie

[upraviť | upraviť zdroj]
  1. ↑ SMOLINSKÁ, M. Ekológia a taxonómia mikroorganizmov. 2017, S. 122
  2. ↑ HUDECOVÁ, D., ŠIMKOVIČ, M. Mikrobiológia. Bratislava: Slovenská technická univerzita, 2014, S. 23
  3. ↑ Tento článok je čiastočný alebo úplný preklad článku Alphaproteobacteria na českej Wikipédii.
  4. 1 2 3 4 Alphaproteobacteria. in: NCBI (prístup: 27. 6. 2026)
  5. 1 2 CAVALIER-SMITH, T. 2002. The neomuran origin of archaebacteria, the negibacterial root of the universal tree and bacterial megaclassification. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52, 14 Jan 2002: 7-76
  6. 1 2 BERGEY’S MANUAL® OF SYSTEMATIC BACTERIOLOGY, SECOND EDITION Release 1.0, April 2001
  7. 1 2 Class Alphaproteobacteria [online]. lpsn.dsmz.de, [cit. 2026-06-27]. Dostupné online.
  8. ↑ Nishii K, Wright F, Chen Y-Y, Möller M (2018) Tangled history of a multigene family: The evolution of ISOPENTENYLTRANSFERASE genes. PLoS ONE 13(8): e0201198. https://doi.org/ 10.1371/journal.pone.0201198
  9. ↑ Class "Caulobacteria" [online]. lpsn.dsmz.de, [cit. 2026-06-27]. Dostupné online.
  10. ↑ CAVALIER-SMITH, T. 1998. A revised six-kingdom system of life. Biol. Rev. 73: 203-266
  11. ↑ MARGULIS, L., SCHWARTZ, K. V. Five Kingdoms. An Illustrated Guide to the Phyla of Life on Earth. Third Edition. NY: W.H. Freeman. 1998. S. 66, 37
  12. ↑ Mehrshad M, Amoozegar MA, Ghai RShahzadeh Fazeli SA, Rodriguez-Valera F. 2016. Genome Reconstruction from Metagenomic Data Sets Reveals Novel Microbes in the Brackish Waters of the Caspian Sea. Appl Environ Microbiol 82:. https://doi.org/10.1128/AEM.03381-15
  13. ↑ WHITMAN, W. B. et al. Proposal of the suffix – ota to denote phyla. Addendum to 'Proposal to include the rank of phylum in th e International Code of Nomenclature of Prokaryotes'. International journal of systematic and evolutionary microbiology ; 68 (2018), 3. – S. 967-969
  14. ↑ J.P. Euzéby: List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature. verzia archivovaná z februára 2007
  15. ↑ J.P. Euzéby: List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature. verzia archivovaná z marca 2008
  16. ↑ List of prokaryotic names with standing in nomenclature. verzia archivovaná z decembra 2013
  17. ↑ List of prokaryotic names with standing in nomenclature. verzia archivovaná z januára 2018
  18. ↑ List of prokaryotic names with standing in nomenclature. verzia archivovaná z apríla 2019
  19. ↑ GTDB – Tree [online]. gtdb.ecogenomic.org, [cit. 2026-06-27]. Dostupné online.

Iné projekty

[upraviť | upraviť zdroj]
Zdroj: „https://sk.wikipedia.org/w/index.php?title=Alfa-proteobaktérie&oldid=8263672“