Po odohraní dvojkolovej základnej časti nasledovala rovnako dvojkolová nadstavbová časť v skupinách o 1.–6. miesto a o 7.–10. miesto. Družstvám sa v nadstavbovej časti započítavali výsledky odohraté v základnej časti. Družstvá na 1. až 2. mieste po nadstavbovej časti postúpili priamo do finále play-off, v poradí ďalšie 2 družstvá postúpili do duelu play-off o 3. miesto. Posledné družstvo zostúpilo do 1. ligy.
V zápase Ružomberka proti Leviciam 6. januára 1999 zaznamenal SCP víťazstvo 182:32, čo je historický rekord v slovenskej extralige a druhý najvyšší rozdiel medzi bodmi víťaza a porazeného v ženských seniorských najvyšších súťažiach na svete po víťazstve Keflavíku na ÍR Reykjavík v islandskej lige D-1 pomerom 185:30 6. januára 1994.[3][4][5]