Systém súťaže sa oproti minulej sezóne zmenil iba čiastočne. Súťaž sa skladala z troch častí–základnej, nadstavbovej a z play-off. V základnej časti hralo 12 tímov dvojkolovým systémom (doma a vonku). 6 najlepších tímov zo základnej časti postúpilo do nadstavbovej skupiny o 1. až 6. miesto. Zvyšné tímy odohrali nadstavbovú skupinu o konečné 7. až 12. miesto, ktorá určila zostupujúci tím do nasledovnej sezóny. Nadstavbové skupiny sa hrali 4-kolovým systémom, pričom sa im započítavali aj výsledky zo základnej časti.[1] Najlepšie 2 tímy v nadstavbovej časti odohrali finálový duel o majstra hraný na 4 víťazné zápasy, tímy na 3. a 4. mieste odohrali duel o bronz hraný na 3 víťazné zápasy a tímy na 5. a 6. mieste duel o konečné 5. miesto hraný na 2 víťazné zápasy.[2]
Na základe účinkovania klubov v európskych súťažiach sa Slovensko v tejto sezóne umiestnilo v európskom rebríčku FIBA, zostavovanom z výsledkov z posledných troch sezón, na 24. mieste so ziskom 2,583 bodov.[4] V samotnej sezóne 1999/00 sa Slovensko v európskych súťažiach so ziskom 1,6 bodov umiestnilo na 26. mieste rebríčka európskych krajín.[5]
Sezóna 1999/00
I. Smiljanič (Košice, 21,2 b/z)
