Systém súťaže sa oproti minulej sezóne zmenil. Súťaž sa skladala po novom už iba z dvoch častí–základnej a z play-off. V základnej časti hralo 10 tímov štvorkolovým systémom (2x doma a 2x vonku).[2] 8 najlepších tímov po základnej časti postúpilo do play-off. 3-kolové play-off začínalo štvrťfinálovými duelmi a končilo duelmi o medailové umiestnenie. Finálový duel sa hral na 4 víťazné zápasy, všetky ostatné duely play-off na 3 víťazné zápasy.[3] Nakoľko sa súťaž v budúcej sezóne mala rozšíriť o dvoch účastníkov, žiaden tím priamo nevypadol, len posledné družstvo po základnej časti odohralo baráž na dva víťazné zápasy s tretím tímom 1. ligy.[5]
Pôvodne mal v európskej súťaži účinkovať Lučenec, konkrétne vo Vyzývacom Pohári FIBA (štvrtá najvyššia európska pohárová súťaž),[6] prihlášku do pohára však neskôr stiahol.[7]
Pozn.: Prvý zápas medzi Košicami a Dolným Kubínom sa odohral najprv v Ružomberku (tam hrával svoje domáce zápasy D. Kubín), pretože košická hala hostila v tom čase výstavu.[8]
Semifinále
Klub 1
Séria
Klub 2
Zápasy
Košice
3:2
Spišská Nová Ves
88: 79, 65: 71, 91:98, 80: 79, 83: 75
Bratislava
3:2
Lučenec
106: 83, 67: 83, 104:84, 61: 82, 103: 99
Play-off o 3. miesto
Klub 1
Séria
Klub 2
Zápasy
Lučenec
1:3
Spišská Nová Ves
65: 49, 57: 82, 80: 88, 70: 92
Finále
Klub 1
Séria
Klub 2
Zápasy
Košice
4:0
Bratislava
69: 60, 91: 90, 82: 80, 102: 84
Pozn.: Boldom sú označené zápasy vyššie nasadeného družstva hrané doma.
hráči: Dejan Stojanović, Štefan Svitek, Juraj Probala, Róbert Bucak, Richard Mišinský, Jozef Zabavník, Richard Leško, Velibor Radović, Ondrej Dura, Ľubomír Utlak, Lukáš Tolmaci, Michal Baťka, Matej Galanda, Ľubomír Lechman
tréner: Goran Miljković (v priebehu sezóny vystriedal Juraja Gacíka)
Sezóna 2006/07
