Fosfopantotenoylcysteíndekarboxyláza
 Fosfopantotenoylcysteíndekarboxyláza z Arabidopsis thaliana | |
| Identifikátory | |
|---|---|
| Číslo EC | EC 4.1.1.36 |
| Číslo CAS | 9024-69-5 |
| Databázy | |
| IntEnz | hľadať v IntEnz |
| BRENDA | hľadať v BRENDA |
| ExPASy | hľadať v ExPASy |
| KEGG | hľadať v KEGG |
| MetaCyc | hľadať v MetaCyc |
| PDB štruktúry | RSCB PDB PDBe PDBsum |
Fosfopantotenoylcysteíndekarboxyláza (PPCD alebo CoaC; EC 4.1.1.36) je enzým, ktorý katalyzuje nasledujúcu chemickú reakciu:
- N-[(R)-4'-fosfopantotenoyl]-L-cysteín 4'-fosfopantoteín + CO2
Substrát tohto enzýmu je teda 4'-fosfopantotenoylcysteín, jeho produkty sú 4'-fosfopantoteín a CO2.[1]
Klasifikácia[upraviť | upraviť zdroj]
Tento enzým patrí medzi lyázy, konkrétne štiepiace väzbu uhlík-uhlík, ktoré štiepia karboxylovú skupinu.
Význam[upraviť | upraviť zdroj]
PPCD sa účastní biosyntézy koenzýmu A (CoA) z kyseliny pantoténovej.[2] Katalyzuje tretí krok tejto dráhy, pričom predchádzajúci krok je katalyzovaný fosfopantotenát-cysteín ligázou a nasledujúci krok katalyzuje fosfopanteteínadenylyltransferáza.[2]
Gén[upraviť | upraviť zdroj]
Nezávisle na sebe bolo zistené, že gén dfp u E. coli má fosfopantotenoylcysteínsyntetázovú a fosfopantotenoylcysteíndekarboxylázovú aktivitu. Jednotlivé domény a k nim prislúchajúce gény, plus homológne gény, ktoré majú len jednu z týchto aktivít, boli neskôr premenované na coaB a coaC. Na základe toho sa PPCD niekedy označuje i ako CoaC, podľa génu, ktorý ju kóduje. Bifunkčný enzým sa potom označuje ako CoaBC.[2]
Štruktúra[upraviť | upraviť zdroj]
PPCD vo svojej štruktúre viaže flavínmononukleotid (FMN).[2] FMN oxiduje cysteín a katalyzuje tvorbu tioaldehydu, ktorý následne dekarboxyluje. Nakoniec dochádza k redukcii tioaldehydu za vzniku cysteamínovej skupiny.[2][3]
U drvivej väčšiny prokaryotov, vrátane Mycobacterium tuberculosis, je tento enzým súčasťou bifunkčného enzýmu, ktorý má zároveň i fosfopantotenoylcysteínsyntetázovú aktivitu.[4]
Na konci roka 2023 bolo známych 11 štruktúr tohto enzýmu, s PDB kódmi 5INT, 1E20, 4QJI, 1QZU, 1U7U, 1U7W, 1U7Z, 1U80, 6THC, 6TGV a 6TH2.
Referencie[upraviť | upraviť zdroj]
- ↑ ENZYME - 4.1.1.36 phosphopantothenoylcysteine decarboxylase [online]. enzyme.expasy.org, [cit. 2023-11-29]. Dostupné online.
- ↑ a b c d e LEONARDI, ROBERTA; JACKOWSKI, SUZANNE. Biosynthesis of Pantothenic Acid and Coenzyme A. EcoSal Plus, 2007-4, roč. 2, čís. 2, s. 10.1128/ecosalplus.3.6.3.4. PMID: 26443589 PMCID: PMC4950986. Dostupné online [cit. 2023-11-29]. ISSN 2324-6200. DOI: 10.1128/ecosalplus.3.6.3.4.
- ↑ STRAUSS, Erick; BEGLEY, Tadhg P.. Mechanistic Studies on Phosphopantothenoylcysteine Decarboxylase. Journal of the American Chemical Society, 2001-07-01, roč. 123, čís. 26, s. 6449–6450. Dostupné online [cit. 2023-11-29]. ISSN 0002-7863. DOI: 10.1021/ja016020y. (po anglicky)
- ↑ MENDES, Vitor; GREEN, Simon R.; EVANS, Joanna C.. Inhibiting Mycobacterium tuberculosis CoaBC by targeting an allosteric site. Nature Communications, 2021-01-08, roč. 12, čís. 1, s. 143. Dostupné online [cit. 2023-11-29]. ISSN 2041-1723. DOI: 10.1038/s41467-020-20224-x. (po anglicky)
Ďalšia literatúra[upraviť | upraviť zdroj]
- Requirement of cytidine triphosphate for the biosynthesis of phosphopantetheine. J. Am. Chem. Soc., 1958, s. 3161. DOI: 10.1021/ja01545a062.
- The metabolism of pantothenic acid. The Journal of Biological Chemistry, February 1959, s. 370–8. PMID 13630913.
Zdroj[upraviť | upraviť zdroj]
Tento článok je čiastočný alebo úplný preklad článku Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase na anglickej Wikipédii.