Intrón: Rozdiel medzi revíziami
d wikilinky, formulácia, kategórie |
Pridanie referencií |
||
| Riadok 16: | Riadok 16: | ||
| strany = 797 |
| strany = 797 |
||
| jazyk = |
| jazyk = |
||
}}</ref> Intróny však boli objavené i u [[Archea|archeí]] (najmä v génoch pre [[rRNA]] a [[tRNA]] |
}}</ref> Intróny však boli objavené i u [[Archea|archeí]] (najmä v génoch pre [[rRNA]] a [[tRNA]] <ref> |
||
{{Citácia periodika |
|||
| priezvisko = |
|||
| meno = |
|||
| autor =Lykke-Andersen J., Aagaard C., Semionenkov M., Garrett R. A. |
|||
| odkaz na autora = |
|||
| spoluautori = |
|||
| titul =Archaeal introns: splicing, intercellular mobility and evolution |
|||
| periodikum =Trends Biochem. Sci. |
|||
| odkaz na periodikum = |
|||
| rok = |
|||
| mesiac =September |
|||
| ročník =22 |
|||
| číslo =9 |
|||
| strany = |
|||
| url = |
|||
| dátum prístupu = 2013-10-22 |
|||
| issn = |
|||
}}</ref> |
|||
, ale aj v génoch kódujúcich proteíny),<ref> {{Citácia periodika |
|||
| priezvisko = |
|||
| meno = |
|||
| autor =Watanabe Y., Yokobori S., Inaba T., ''et al'' |
|||
| odkaz na autora = |
|||
| spoluautori = |
|||
| titul =Introns in protein-coding genes in Archaea |
|||
| periodikum =FEBS Lett. |
|||
| odkaz na periodikum = |
|||
| rok = |
|||
| mesiac =January |
|||
| ročník =510 |
|||
| číslo =1-2 |
|||
| strany =27-30 |
|||
| url = |
|||
| dátum prístupu = 2013-10-22 |
|||
| issn = |
|||
}}</ref><ref> |
|||
{{Citácia periodika |
|||
| priezvisko = |
|||
| meno = |
|||
| autor =Yoshinari S., Itoh T., Hallam S. J., ''et al'' |
|||
| odkaz na autora = |
|||
| spoluautori = |
|||
| titul =Archaeal pre-mRNA splicing: a connection to hetero-oligomeric splicing endonuclease |
|||
| periodikum =Biochem. Biophys. Res. Commun. |
|||
| odkaz na periodikum = |
|||
| rok =2006 |
|||
| mesiac =August |
|||
| ročník =346 |
|||
| číslo =3 |
|||
| strany =1024–32 |
|||
| url = |
|||
| dátum prístupu = 2013-10-22 |
|||
| issn = |
|||
}}</ref> v niekoľkých prípadoch aj u [[Baktérie|baktérií]]. <ref> |
|||
{{Citácia periodika |
|||
| priezvisko = |
|||
| meno = |
|||
| autor =Belfort M, Reaban ME, Coetzee T, Dalgaard JZ |
|||
| odkaz na autora = |
|||
| spoluautori = |
|||
| titul =Prokaryotic introns and inteins: a panoply of form and function |
|||
| periodikum =J. Bacteriol. |
|||
| odkaz na periodikum = |
|||
| rok =1995 |
|||
| mesiac = |
|||
| ročník =177 |
|||
| číslo =14 |
|||
| strany =3897–903 |
|||
| url = |
|||
| dátum prístupu = 2013-10-22 |
|||
| issn = |
|||
}}</ref><ref> |
|||
{{Citácia periodika |
|||
| priezvisko =Mohr |
|||
| meno =G. |
|||
| autor = |
|||
| odkaz na autora = |
|||
| priezvisko2 =Ghanem |
|||
| meno2 =E. |
|||
| autor2 = |
|||
| odkaz na autora2 = |
|||
| priezvisko3 =Lambowitz |
|||
| meno3 =A. M. |
|||
| autor3 = |
|||
| odkaz na autora3 = |
|||
| spoluautori = |
|||
| titul =Mechanisms Used for Genomic Proliferation by Thermophilic Group II Introns |
|||
| prekladatelia = |
|||
| ilustrátori = |
|||
| fotografi = |
|||
| ďalší = |
|||
| periodikum =PLoS Biology |
|||
| odkaz na periodikum = |
|||
| vydavateľ = |
|||
| miesto = |
|||
| dátum = |
|||
| rok =2010 |
|||
| mesiac =jún |
|||
| deň =8 |
|||
| ročník =8 |
|||
| typ ročníka =zväzok |
|||
| číslo =6 |
|||
| typ čísla = |
|||
| strany = |
|||
| poznámky = |
|||
| url =http://www.plosbiology.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pbio.1000391 |
|||
| dátum prístupu = |
|||
| rok prístupu = |
|||
| mesiac prístupu = |
|||
| deň prístupu = |
|||
| formát =PDF |
|||
| issn = |
|||
| doi = |
|||
| pmid = |
|||
| id = |
|||
| jazyk =anglický |
|||
}}</ref> |
|||
== Vznik a evolučné dôsledky == |
== Vznik a evolučné dôsledky == |
||
Význam intrónov nie je úplne jasný. Existuje niekoľko teórií, ktoré vysvetľujú ich vznik a význam. |
Význam intrónov nie je úplne jasný. Existuje niekoľko teórií, ktoré vysvetľujú ich vznik a význam. |
||
Verzia z 16:12, 22. október 2013
Intrón je oblasť DNA a pre-mRNA, ktorá sa neprekladá do proteínu, ale vystrihuje sa v priebehu tvorby mRNA mechanizmom zvaným splicing (zostrih). Spolu s exónmi tvorí základ génu.
Výskyt
Intróny môžeme bežne nájsť v genómoch organizmov z nadríše Eukaryota, kam sa zaraďujú napríklad všetky rastliny, živočíchy a pod. [1] Intróny však boli objavené i u archeí (najmä v génoch pre rRNA a tRNA [2] , ale aj v génoch kódujúcich proteíny),[3][4] v niekoľkých prípadoch aj u baktérií. [5][6]
Vznik a evolučné dôsledky
Význam intrónov nie je úplne jasný. Existuje niekoľko teórií, ktoré vysvetľujú ich vznik a význam.
Parazitický pôvod
Intróny mohli byť pôvodne genómoví paraziti typu vírusov a transpozónov, ktoré bunke neprinášajú úžitok, iba sa množia tým, že sa nakopírujú a vložia sa na ďalšie miesto v genóme hostiteľa. V populácii sa šíria vertikálne, t.j. z rodiča na potomka. Niektoré intróny sú schopné autosplicingu, vďaka čomu sa dokážu vystrihnúť z mRNA bez cudzej pomoci. Aby intróny nezabíjali bunky, musia sa vedieť v priebehu translácie inaktivovať, na čo slúži práve splicing.
Zvýšenie evolučného potenciálu
Podľa tejto teórie umožňujú intróny účinnejší vznik nových génov prestavbou starých. Intróny sa v génoch nachádzajú v oblastiach, ktoré oddeľujú jednotlivé proteínové domény. Taktiež môžu uskutočňovať crossing-over tým, že znižujú pravdepodobnosť rekombinácie "vo vnútri" génovej sekvencie a tým i poškodenie génu postihnutím čítacieho rámca (pozri mutácia)
Napojenie histónov
Táto hypotéza predpokladá schopnosť posúvať históny po DNA tak, že regulujú vystavenie regulačných miest génu podľa toho, či je regulačná sekvencia namotaná na histón, alebo sa nachádza v cytoplazme.
Referencie
- ↑ ROSYPAL, Stanislav. Nový přehled biologie. Praha : Scientia, 2003. ISBN 80-7183-268-5. S. 797.
- ↑ Lykke-Andersen J., Aagaard C., Semionenkov M., Garrett R. A.. Archaeal introns: splicing, intercellular mobility and evolution. Trends Biochem. Sci., roč. 22, čís. 9.
- ↑ Watanabe Y., Yokobori S., Inaba T., et al. Introns in protein-coding genes in Archaea. FEBS Lett., roč. 510, čís. 1-2, s. 27-30.
- ↑ Yoshinari S., Itoh T., Hallam S. J., et al. Archaeal pre-mRNA splicing: a connection to hetero-oligomeric splicing endonuclease. Biochem. Biophys. Res. Commun., August 2006, roč. 346, čís. 3, s. 1024–32.
- ↑ Belfort M, Reaban ME, Coetzee T, Dalgaard JZ. Prokaryotic introns and inteins: a panoply of form and function. J. Bacteriol., 1995, roč. 177, čís. 14, s. 3897–903.
- ↑ MOHR, G.; GHANEM, E.; LAMBOWITZ, A. M.. Mechanisms Used for Genomic Proliferation by Thermophilic Group II Introns. PLoS Biology, 8. jún 2010, zväzok 8, 6. Dostupné online [PDF]. (anglický)