Endopeptidáza
Endopeptidáza[1] je proteolytická peptidáza, ktorá štiepi peptidové väzby medzi aminokyselinami vnútri bielkovinového reťazca.[1][2] Popri endopeptidázach existujú exopeptidázy, ktoré štiepia peptidové väzby na jednotlivých koncoch reťazca.[1] Z tohto dôvodu nevedia endopeptidázy štiepiť peptidy a bielkoviny na monomérne jednotky (aminokyseliny), zatiaľ čo exopeptidázy áno. Špeciálnym prípadom endopeptidázy je oligopeptidáza, ktorej strubstrátom sú oligopeptidy namiesto celých bielkovín.
Väčšina endopeptidáz štiepi špecifické väzby za alebo pred konkrétnymi aminokyselinami. Táto špecificita môže byť rôzna, čo umožňuje postupné štiepenie celého proteínu.[1] Medzi príklady endopeptidáz patria:
- Trypsín[1] - štiepi za Arg alebo Lys, ak za nimi nenasleduje Pro. Veľmi striktný, optimálne pH je 8.
- Chymotrypsín[1] - štiepi za Trp,[chýba zdroj] Phe alebo Tyr, ak za nimi nenasleduje Pro. Štiepi pomalšie po His, Met alebo Leu.[chýba zdroj] Optimálne pH je 8.
- Elastáza[1] - štiepi za neutrálnymi aminokyselinami, ak ich nenasleduje Pro.
- Pepsín[1] - štiepi pred Leu, Trp,[chýba zdroj] Phe alebo Tyr, ak sa pred nimi nenachádza Pro. Optimálne pH je 2.
- Enteropeptidáza, enterokináza[1] - štiepi trypsinogén, konkrétne za karboxylovou skupinou Lys v počiatočnej sekvencii DDDDKX.[3]
- Termolyzín - štiepi pred Ile, Met, Phe, Trp, Tyr alebo Val, ak sa pred nimi nenachádza Pro. Niekedy štiepi za Ala, Asp, His alebo Thr.[chýba zdroj]
Referencie
[upraviť | upraviť zdroj]- ↑ a b c d e f g h i ŠKÁRKA, Bohumil; FERENČÍK, Miroslav. Biochémia. 3. vyd. [s.l.] : [s.n.], 1992. ISBN 80-05-01076-1. S. 360, 688.
- ↑ endopeptidase [online]. Merriam-Webster. Dostupné online. Archivované 2017-01-18 z originálu.
- ↑ TERPE, K.. Overview of tag protein fusions: from molecular and biochemical fundamentals to commercial systems. Applied Microbiology and Biotechnology, 2003-01, roč. 60, čís. 5, s. 523–533. Dostupné online [cit. 2022-04-09]. ISSN 0175-7598. DOI: 10.1007/s00253-002-1158-6. (po anglicky)
Zdroj
[upraviť | upraviť zdroj]
Tento článok je čiastočný alebo úplný preklad článku Endopeptidase na anglickej Wikipédii.
|
Tento článok týkajúci sa chémie je zatiaľ „výhonok“. Pomôž Wikipédii tým, že ho doplníš a rozšíriš. |