Xantozíndifosfát

z Wikipédie, slobodnej encyklopédie
Xantozíndifosfát
Xantozíndifosfát
Xantozíndifosfát
Všeobecné vlastnosti
Sumárny vzorec C10H14N4O12P2
Systematický názov kyselina [((2R,3S,4R,5R)-5-[2,6-bis(oxidanylidén)-3H-purín-9-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolán-2-yl]metylfosfónohydrogénfosforečná
Synonymá XDP
Fyzikálne vlastnosti
Molárna hmotnosť 444,19 g/mol
Ďalšie informácie
Číslo CAS 29042-61-3
SMILES C1=NC2=C(N1[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)COP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O)O)NC(=O)NC2=O
3D model (JSmol) Interaktívny 3D model
Pokiaľ je to možné a bežné, používame jednotky sústavy SI.
Ak nie je hore uvedené inak, údaje sú za normálnych podmienok.

Xantozíndifosfát (XDP) je ribonukleoziddifosfát odvodený od xantozínu. Skladá sa z nukleovej bázy xantínu, pentózy ribózy a dvoch fosfátových skupín.

Metabolizmus[upraviť | upraviť zdroj]

XDP vzniká pôsobením inozín/xantozíntrifosfatázy (EC 3.6.1.73), ktorá štiepi fosfátovú skupinu z xantozíntrifosfátu (XTP):[1][2][3]

XTP + H2O → XDP + Pi

Tento enzým takisto premieňa inozíntrifosfát (ITP) na inozíndifosfát (IDP). ITP a XTP vznikajú deamináciou adenozíntrifosfátu (ATP) a guanozíntrifosfátu (GTP), takže sa predpokladá, že tento enzým pomáha predchádzať chybnému začleneniu ITP a XTP do nukleových kyselín.[3]

V septembri 2023 nebola známa žiadna cesta, ktorou by sa XDP premieňal na iné látky.[4]

Stanovenie[upraviť | upraviť zdroj]

XDP možno stanoviť pomocou katodickej rozpúšťacej voltametrie, pretože sa veľmi dobre adsorbuje na povrch ortuťovej elektródy.[5]

Referencie[upraviť | upraviť zdroj]

  1. KEGG ENZYME: 3.6.1.73 [online]. www.genome.jp, [cit. 2023-09-16]. Dostupné online.
  2. EC 3.6.1.73 [online]. iubmb.qmul.ac.uk, [cit. 2023-09-16]. Dostupné online.
  3. a b ZHENG, Jimin; SINGH, Vinay Kumar; JIA, Zongchao. Identification of an ITPase/XTPase in Escherichia coli by Structural and Biochemical Analysis. Structure, 2005-10, roč. 13, čís. 10, s. 1511–1520. Dostupné online [cit. 2023-09-16]. ISSN 0969-2126. DOI10.1016/j.str.2005.07.007.
  4. KEGG PATHWAY: Nucleotide metabolism - Reference pathway [online]. www.genome.jp, [cit. 2023-09-16]. Dostupné online.
  5. TEMERK, Yassien M.; KAMAL, Moustafa M.; IBRAHIM, Mohamed S.. Chelate Adsorption for Trace Voltammetric Determination of Xanthosine 5′-Monophosphate and Xanthosine 5′-Diphosphate. Microchimica Acta, 2006-02-01, roč. 153, čís. 1, s. 57–64. Dostupné online [cit. 2023-09-16]. ISSN 1436-5073. DOI10.1007/s00604-005-0386-8. (po anglicky)

Pozri aj[upraviť | upraviť zdroj]